东北师大附中学生社团始建于1998年，是由学生自主建设管理、指导教师指导的学生组织，所有社团组成社团联合会，由自联体社务协理理事长和社务司负责。目前学校共有22个一级级社团、6个二级社团和2个三级社团，选聘指导教师27名，有固定社团活动场地9处、配套校本活动类课程12门，注册社团成员850人，参与社团活动近1600人次。社团每学期举行纳新活动，每年开展社团活动周。

蜚声传媒联合协会、粉墨青春话剧社、T5舞蹈协会、High Point健美操协会、绿色天空合唱团等在运动会、科技节、教师联欢会、圣诞节派对、文化广场汇演、校庆等大型活动中均有精彩表现；东方之音模拟联合国社团、智能先锋机器人协会、EP潜动力节能车队等在各大比赛中取得了优异成绩；一格文学社、恰恰用学生超市、翰林苑书画协会等作为特色社团，不断丰富同学们的校园文化生活。